概念不同
新媒体就是相对于传统媒体（报刊、广播、电视等）而发展起来的一种新的媒体形态，包括网络媒体、手机媒体、数字电视等。新媒体概念比较宽泛，是利用数字技术、网络技术，通过互联网、宽带局域网、无线通信网、卫星等渠道，以及电脑、手机等终端，为用户提供信息和娱乐服务。严格地说，新媒体应该称为数字化新媒体。而自媒体，通常为个人或者小的团队开通的媒体号，依托于网站、微信、微博、头条号、UC号、大鱼号、企鹅号等等。比如咪蒙和派酱。

运营思路不同
新媒体主要用来打造企业品牌形象，靠企业的官网、公众号，小程序等进行延伸拓展，一般对应是订阅者和用户本身。但是自媒体主要打造个人品牌形象，通过多种号进行大量传播，目标是粉丝。做好个人品牌能够快速的与粉丝拉近距离，效果好的话商业价值相当庞大。

来源不同
新媒体内容主要由门户网站，大型信息平台，视频网站，小说平台等提供，而且内容来源大不同，有些是平台自己制造，有些是由会员管理产生。但是自媒体基本由运营者提供。

盈利模式不同
新媒体主要用来打造一个能给别人提供信息交流和互动的平台，通过会员、广告位、信息费等方式产生利润，但是自媒体则是主要打造一个有粘度和个人魅力的形象，通过软文、广告产生利润的。